LED交通信号灯由它的控制系统进行控制，目前市场上的交通信号灯的控制方式主要有定时控制、感应控制、自适应控制、干线协调、联机、远程实时控制这六种。
1、定时控制：
交叉路口交通信号控制机均按事先设定的配时方案运行，也称定周期控制。一天只用一个配时方案的称为单段式定时控制；一天按不同时段的交通量采用几个配时方案的称为多段式定时控制。
2、感应控制：
感应控制是在交叉口进口道上设置车辆检测器，LED交通信号灯配时方案由计算机或智能化信号控制机计算，可随检测器检测到的车流信息而随时改变的一种控制方式。感应控制的基本方式是单个交叉口得感应控制，简称单点控制感应控制。
3、自适应控制：
把交通系统作为一个不确定系统，能够连续测量其状态，如车流量、停车次数、延误时间、排队长度等，逐渐了解和掌握对象，把他们与希望的动态特性进行比较，并利用差值以改变系统的可调参数或产生一个控制，从而保证不论环境如何变化，均可使控制效果达到最优或次优控制的一种控制方式。
4、干线协调：通过线路控制LED交通信号灯的工作状态，利用电路原理对交通信号灯进行控制。
5、联机：接入交通信号灯数据接口，通过接口与控制机器相联，在控制机器端对交通信号灯进行控制。
6、远程实时控制：把交通信号灯数据传输接口接入局域网络中，可对交通信号灯进行实时远程控制，可以防范突发事故。