高压水射流清洗机清洗工业管道的原理是利用喷头前部的旋转高压水射流将管道内壁上的积垢切割粉碎，再由喷头后部的高压水射流将污垢排出，向后喷射头产生的反作用力用于将喷头和高压软管向前推进。
当喷头达到管道的另外一端时，可以适当的减小压力。而后高压软管在卷管器拉力的作用下被强制后移，从而进一步的清洗管壁，并将剩余的杂物带到管外，以达到清洗管道的目的。
现今，工业管道清洗主要有管道、管束和容器内壁三大类。工业管道清洗因垢层厚且硬，管线又长，所以清洗难度也就越大。高压水射流清洗机在对工业管道清洗时主要有两个方面，第一是对大功率泵机组的要求，第二是对喷头的要求。清洗管道垢层业内的叫法称为除结疤，由于作业现场高压软管要在150m以上，所以压力损失也相对较大。对于这种大功率的高压水射流清洗机，必须提高自动化控制水平，高压软管输送也必须依赖送管器强制进行。
由于高压水射流清洗机清洗工业管道时依靠超高压大流量水射流驱动喷头前行，所以根据不同的管道直径又设计出多种喷头。而旋转喷头的技术性要求很强，转速太快则会导致水射流雾化，转速太慢又容易卡死。所以，旋转喷头的设计都要考虑减速。
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