燃料电池发动机二次开发操控体系的体系构造按其功用可分以下几部分：上位机装备终端、可软装备操控器、燃料电池电堆、氢气供应体系、空气供应体系、增湿体系、冷却水办理体系、安全报警体系以及通讯监控体系，燃料电池发动机以上位机作为软装备终端，以操控器为操控和协调中间，以燃料电池电堆为发动机的中心，进入电堆的氢气和氧气在必定的条件下反响，发作电能和水。上位机装备终端能够挑选不一样的操控战略，也能对操控器进行二次开发晋级；氢气供应体系担任给电堆供应必定压力和流量的纯洁氢气；空气供应体系向电堆供应满意的空气用于反响；增湿体系担任向电堆供应恰当的湿度以便于进步反响效率；冷却水办理体系首要将电堆宣布的剩余热量经过循环去离子水带出电堆并经过冷却器散热，使电堆处于高效的反响条件下作业；安全报警体系经过实时检查电堆作业过程中的各种状况和参数，在毛病出现时及时宣布报警信息；通讯监控体系可实时显现当时的各种物理数据和运转状况，并可将所需数据记录下来以便研讨剖析。
二次开发晋级机制
燃料电池发动机二次开发操控体系的一个特点是能够在线晋级。已有统计资料标明操控体系的完善性和适应性保护作业量占其生存期作业量的70%左右。被动地去保护和修改在生命期中发作需要改变的操控体系进而从头烧写乃至设计操控器，其花费较为昂贵。燃料电池发动机操控体系是一个内部构造能够从头装备、操控参数能够不断调理以满意硬件环境的操控体系，按其晋级的功用可分为操控器端口晋级和参数晋级。
操控器
操控器在设计时就充沛考虑到可能发作改变的各种因素，主程序只保存首要结构，一切可变信息都独自存贮在专门的模块中。上位机装备终端担任挑选体系运转战略以及将各种晋级信息装备到操控器中，一旦体系需要晋级，用户能够在不了解操控程序的情况下进行简略操作，大大缩短了操控器的开发周期，进步了体系的适用性与可操作性。
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